话说秦并六国后，建立了郡县二级政权的地方行政制度。同时上一篇文章也说到了“州”这个概念，东汉末年“州”正式成为了一个行政，有了州-郡-县三级行政制度。
维基百科的下面这段话很好的解释了郡县的来源：
县
周武王分封诸侯之时，由于不愿意给诸侯过大的封地，又不愿分封太多的异姓诸侯，导致“有许多地方既非王畿又无适当的人可封”，这些土地“悬而未决”，只能暂时派人管理，等待有合适的人来封，称为“悬之”，后来就演化成了“县”。
春秋时期诸侯兼并，大国灭掉小国之后如不愿将该地分封给大夫，也会设置为县。如楚国就先后将权国、陈国、蔡国灭掉立县。晋国也曾将大夫的封地划分出一块设置为县以加强中央集权。设县主要原因是国土日益变大，如不能分封，中央直接管理也麻烦，所以设置县，交给县尹、县令、县公、县大夫管辖，“使其成为独立的地方政治单位而直属于中央”。所以春秋时期的县只有“晋、楚、秦、齐、吴等大国”有，而小国不需要设县。至战国时代这种制度逐渐为各强国采用，逐渐减少分封于贵族的地区。
郡
秦始皇之前的郡与国防军事有关。郡多设在边境，为防止邻国侵袭则需有大将戍边，集财政大权与一身，直接听命于中央，这样灵活而有战斗力。相当于“军事特别区”。
早期县和郡的关系
县和郡是两种不同的地方政治单位。周朝时县大于郡，《逸周书作雒》：“千里百县，县有四郡”；《左传》哀四年：“克敌者，上大夫受县，下大夫受郡”。但因为郡经常参与战争，郡守比县令有更大的权力，而且新征服的土地设县后往往也要受郡的节制。同时郡守需要有经验有能力的大将担任，普遍比县令能力强。因此郡的地位后来就比县高了。
秦帝国以后的郡县制
中国历史地方行政一向推崇汉朝，所谓两汉吏治。
秦始皇统一天下后，曾出现过应否置郡的争论。当时不少大臣都主张实行分封，授各地贵族予世袭的诸侯名分，惟身为廷尉的李斯却力排众议实行郡县制，并得到秦始皇的采纳。在郡县制底下，共设三十六郡（后增至四十一郡），每郡有守（相当于省长）、尉（相当于防区司令）和监（相当于监察专员）各一。郡下辖县；郡（守）与县（令），由皇帝直接任命。
汉代承袭这个制度。西汉建立之初，但也分封了一些诸侯国，郡县制与分封制并行，所以又称为郡国制。吴、楚七国之乱后诸侯国的权力被极大削弱，郡县制成为主体。大体汉代有一百多个郡，以一个郡有十多个县计，县总数有一千一百到一千四百多个。汉代郡长官为太守，秩二千石。和当时九卿秩中二千石，地位大致平等。汉代郡太守表现的好，可以调到中央朝廷可以做九卿（类似今日各部的部长），算是升级，但名义上好像差别不大（名义上都是二千石的官）；若九卿再晋升，就是三公，是万石。九卿，也可以外调出来也做郡太守或国相，这一定程度而言也算是降调，但级别落差不像唐朝的六部尚书被流放到地方上的州刺史，两者职等差别那么大。而汉朝时代，尽管中央政府大一统，地方行政区域划分得小，当时郡太守名位和九卿，比起唐代是较为相近的。
当然历史发展的过程总会经历太多的变迁。郡县制度也逐渐在发展并部分废弃。
秦始皇消灭六国统一天下，六国人民并不心服，各地都有驻留兵力的必要，所以分天下为三十六郡，郡下统县，成为中国第一个统一王朝的郡县二级行政区划设置。西汉由于恢复了一定程度的分封制，所以郡的同级还出现了诸侯王国，以郡、国统县，仍然是二级制。郡的数量也大大增加，由秦末的约48郡，增加到了汉朝的约102郡。
东汉末年三国时期，原来只起监察作用的13个州成为正式的一级行政区，郡成为州以下的二级行政区。此后，历经三国、东晋、南北朝等分裂割据局面，由于大量增分建制，州郡县三级行政区划体系发生重大转变。最后全国出现了200多个州、600多个郡、1000多个县，一州只有两三个郡、一郡只有两三个县，介于州县之间的郡的实际意义几乎不复存在。
隋文帝在中国统一后，废除了天下各郡，实行州县二级制。不久后，隋炀帝又改州为郡，恢复到了秦汉的郡县二级制。唐朝建立后，再次改郡为州，但到了唐玄宗时又改州为郡，这也是郡最后一次作为正式行政区划出现。到了唐玄宗禅让，唐肃宗登基后，再次改郡为州，从此中国不再使用郡的划分。但宋朝的州则有一个郡名作别名，后来的大理国和太平天国等政权亦设置过郡。
隋废郡，以州领县，太守之官遂废，以州刺史取代郡守一职。此后太守不再是正式官名，仅用作刺史或知府的别称。宋代以后，时雅称知府、知州等官为太守。如〈醉翁亭记〉：“太守谓谁？庐陵欧阳修也。”
郡/州这一级行政长官称谓：郡守-太守-州刺史/刺史-知府/知州
注意：东汉某年的州刺史和后世隋文帝、唐代的州刺史实际意义不一样；前者是州-郡-县三级，后者是州-县二级
References:
https://zh.wikipedia.org/wiki/郡县制
https://zh.wikipedia.org/wiki/郡
https://zh.wikipedia.org/wiki/太守
https://zh.wikipedia.org/wiki/刺史